6 batalion dowodzenia przeznaczony jest do zabezpieczenia funkcjonowania systemu dowodzenia 6 Brygady Powietrznodesantowej, jako odwodu aeromobilnego zgrupowania operacyjnego w ramach połączonej operacji obronnej. Jednocześnie odpowiada za przygotowanie sił do prowadzenia rozpoznania oraz realizacji zadań zabezpieczenia inżynieryjnego, OPBMR i OPL w czasie prowadzenia działań powietrznodesantowych w ugrupowaniu własnym i przeciwnika. 

Dodatkowo batalion utrzymuje w gotowości siły i środki do przeciwdziałania sytuacjom kryzysowym.